Proteomanalyse/ Proteomik (Proteinanalytik / [LS-8 NEU]

Ziel:
Einführung in die Proteomanalyse/Proteomik als qualitative und quantitative Analyse komplexer Protein- und Peptidgemische (z. B. aus Zellkulturen oder biologischem Gewebe) mit dem Schwerpunkt HPLC-Massenspektrometrie. Ziel ist es, Ihnen einen Überblick über das Thema mit seinen Fragestellungen und Methoden zu verschaffen, die Grundlagen zu vermitteln und für bestimmte / typische Fragestellungen gemeinsam mögliche Strategien und Lösungsansätze zu diskutieren.

Inhalt:

•  typische Fragestellungen der Proteomanalyse (Proteomvergleiche, Suche nach Interaktionspartnern von Zielproteinen, posttranslationale Modifikationen)
• Planung: von der Probenvorbereitung bis zur Auswertung
• HPLC-MS Analyse / Chromatographie und Massenspektrometrie (z B. > 10.000 Peptide pro Lauf)
• Instrumentarium: Nanoflow-HPLC / MS (MS-Hybridsysteme) / Messmethoden
• Prinzipien der Identifizierung und Quantifizierung (Mit und ohne Isotopenlabel)
• posttranslationale Modifikationen
• Tipps und Diskussion einiger Fehlerquellen

Zielgruppe:

Neueinsteiger und Anwender, die Anregungen für Ihre Fragestellungen suchen. Grundkenntnisse in HPLC und Massenspektrometrie von Vorteil.

Durchführung / Arbeitsweise:

Fachvorträge im Dialog mit den Teilnehmenden, Diskussion, anwendungsbezogener Erfahrungsaustausch.